El principal objetivo de una auditoria financiera es emitir una opinión de que las operaciones registradas en la contabilidad fueron registradas de acuerdo con las normas de información financiera y las distintas disposiciones fiscales que se encuentren vigentes en el momento, pudiendo evaluar si los estados financieros de la empresa presentan la situación financiera real, evaluando de la misma forma el resultado de sus operaciones y los cambios de su posición financiera.

De la misma forma una auditoria para fines fiscales determina la exactitud e integridad de la operación de la empresa y el cálculo, pago y entero de sus contribuciones fueron determinadas de la forma correcta de acuerdo con las distintas disposiciones fiscales vigentes, evitando una contingencia ante alguna autoridad federal o local y se distraiga la sociedad de los fines para la cual fue creada.